小麦腥黑穗病是局部发生性病害，发生严重地块减产或绝收，病田的小麦轻者面粉品质下降，重者失去食用价值。腥黑穗病小麦植株略矮、分蘖增多，麦粒颖片稍张开，露出病粒。病粒比健全粒稍粗短，成椭圆或不规则圆形，内部充满黑粉，有鱼腥味，故称腥黑穗病。
小麦腥黑穗病通过带病种子和土壤、秸秆等传播，严重威胁小麦种植生长，不仅使小麦减产甚至绝收，而且还会减低小麦品质，病麦及面粉含有有毒物质三甲胺，人畜不能食用。不能市场销售。当病粒率超过3%时，必须深埋处理。
小麦腥黑穗病的防治方法：
１、选用抗耐病优质良种。对于往年发生过小麦腥黑穗病的田块及附近田块绝不能留种，全部要换用合格新麦种，减低种子带病的风险。严禁病区自行留种、串换麦种；
２、适期播种，合理轮作。播种不宜过迟过深，可促进幼苗早出土，减少病菌侵染的机会而减少发病。合理轮作倒茬，减低土壤病原数量。
3、药剂拌种。药剂拌种是防治小麦腥黑穗病经济有效的措施。可用咯菌腈、戊唑醇等药剂拌种。拌种药剂可选用2%戊唑醇干拌剂或湿拌剂100～150克拌麦种100千克或2.5%咯菌腈悬浮剂100～200毫升拌麦种100千克。均匀拌种后晾干播种。
4、病田土壤药剂处理。病田应采取药剂拌种加土壤处理双管齐下的办法。每亩用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂2公斤左右，或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1-1.5公斤，拌细土45～50千克，均匀撒在地面，然后翻耕入土。
5、5月中下旬，零星病区可拔除田间小麦腥黑穗病病株，全株深埋处理。重发田块应收割堆放、集中深埋处理。铲除消灭病麦秸秆、麦穗等一切病残体。
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