近年来，气候多变，抽穗扬花期容易遇阴雨天气，使得病菌容易侵染水稻。随着两系杂交稻的推广和大面积种植，对肥水要求提高，在产量提高的同时，也为稻曲病的发生流行创造了有利条件。
稻曲病在水稻破口前七天后，即水稻叶枕平后，开始从水稻颖壳间隙侵入谷粒内，通过首先感染水稻花丝，阻止水稻花粉的成熟，然后阻断子房受精，之后劫持其营养库，吸收水稻灌浆时营养，而形成稻曲球。而在水稻开花后，花丝凋谢，稻曲病病菌由于丧失初侵染源，不再感染水稻。
如何判断何时进入破口期？
水稻的破口期是稻穗刚刚从叶鞘内露头、抽出的时期。此时，水稻的叶片生长全部完成、水稻的拔节过程基本已经结束、水稻的株高也即将固定。
通常情况下，水稻的主茎和低位分蘖的破口期会持续大概3-4天左右，其余的晚生分蘖还会向后推迟。所以，在破口期防治水稻病害的时间较为充足。
稻曲病理想防治时间：水稻叶枕平时期
水稻稻曲病的防治，施药时间较为关键，理想时间是在水稻破口前7天，即水稻剑叶完全抽出时。用药时间需要在水稻破口抽穗前施药，在抽穗扬花后药剂防治不起任何效果。
稻曲病防治药剂推荐：肟菌戊唑醇、苯甲丙环唑、井冈霉素等。
水稻稻曲病防治口诀：
稻曲病气候病，多雨年份会爆发
稻曲病穗期病，大穗易感几率大
稻曲病危害大，偏施氮肥易发病
稻曲病真要命，影响产量降品质
稻曲病要预防，防治时期是关键
裂苞期来施药，齐穗看天来补防
稻曲病要预防，防治药剂很重要
多元复配高效，防病提质效果好
防稻曲别马虎，感染以后无可救
铜制剂打稻曲，菌丝收干能掉落
苯甲丙防稻曲，量足实惠又高效
稻曲病防治误区：
1.稻曲病出来了，再去把灰苞打掉？
这是下策，这时水稻品质已经下降且卖不上价格，很多农民朋友误认为铜制剂可以把稻曲病打落，其实是铜制剂把稻曲病菌丝打收干，风吹以后掉落。感病的谷粒依然不能恢复，所以稻曲病防治远远大于后期进行防治。
2.防治一次就可以了？
一般需要防治2次。水稻剑叶抽出至叶枕平；首次全田三分之一以上主茎秆一片叶子全部抽出，即俗称“打大肚苞”时用药（约距出穗时间5-7天左右）。第二次防治不要在齐穗期防治，这时防治效果不好，一定在水稻全田出穗50%时候防治效果好。（来源：克山农技推广、龙粮网）
