花椒树修剪的主要作用一是有利于生长和结果，提高产量。二是修剪可以改善光照条件和预防病虫害。花椒树在修剪时要把握一个原则：主枝少，小枝多。一般留3~5个主枝即可，小枝为结果枝，要让枝组和侧枝合理均匀分布。
老龄树的修剪。首先清理病虫枝、枯干枝，然后修剪内向枝、交叉枝、重叠枝，然后把树冠周围每一枝条顶端剪去10公分。老树和弱树的修剪，以更新复壮为主，重缩或疏除弱小枝组。充分利用徒长枝，补充残缺树冠，保持适当地结果面积。
成年结果椒树的修剪。结果树修剪时，以维持树势健壮，调节花量为主。枝条密挤时以疏为主，疏上缓下，疏除影响光照的多余大枝，保持良好的通风透光条件。对过密、细弱、交叉、徒长及病虫枝，也要及时疏除，使冠内枝组健壮、均衡，通风透光。注意留枝均匀，后部不要光秃。
幼树和初挂果树的修剪。幼苗定植的当年或第二年冬季在基干25~30厘米处，剪去顶端；初挂果的幼龄树整形和结果并重，修剪量宜从轻，一般不短截，只进行些撑、拉和曲枝等。留好骨干枝，剪去多余枝，基部萌发枝条留好主枝3~5个，其余从基部剪去。来源：农业科技报
