近些年来，因稻秧密度的增加，尤其是在直播稻推广的阶段，群体密度加大，禾苗荫蔽度增加；矮秆、宽叶、分蘖力强的高产良种的推广；各地施肥水平的提高等，纹枯病的发生每年都呈现重发的趋势，一般早稻重于单季稻和连作晚稻。下面就如何防治纹枯病整理一下。
防治纹枯病的重点是保护好功能叶，在水稻生长中后期（孕穗至抽穗期）用药，主要是抑制纹枯病菌核的形成和控制其垂直扩展，保护稻株上部功能叶不受侵害。纹枯病发生重，病斑向功能叶上扩展，会影响水稻灌浆充实，造成严重减产。一般早稻在6月中下旬，上部3张功能叶已抽出，田间郁闭，再加上稻田晒田复水后湿度大，有利于纹枯病的水平和垂直扩展，导致上部功能叶出现病斑，必须抓紧做好防治工作。
井冈霉素是目前生产上用于防治水稻纹枯病的主要药剂，使用30多年来防效一直较稳定。但由于长期使用，水稻纹枯病菌对井冈霉素的抗药性已有所上升，部分地区可能已出现抗性很强的病菌，但从生产上的总体情况来看，抗性并不强，因此不要盲目增加井冈霉素的用量，一般亩用5%井冈霉素水剂250-300毫升，或者亩用20%井冈霉素可溶性粉剂60-75克，即可取得良好的防效。井冈霉素对纹枯病的控制时间较短，持效期一般只有7天左右，在大发生年份或者发病重的田块，需要多次用药才能取得良好的防治效果。
目前用于水稻纹枯病的持效期长的药剂中，用于防治的主要有满穗240克/升噻呋酰胺悬浮剂，对纹枯病有良好的预防和作用，持效期长达30天左右。在纹枯病发生初期（一般在拔节孕穗期用药），每亩用该制剂20毫升加水30公斤喷雾，一次用药即可基本水稻不受纹枯病危害。如在田间水稻纹枯病发生重时再用药，其防治效果会受到影响，在次喷药后7-10天再喷1次药。该药对水稻性好，即使加倍量使用，也不会对水稻产生药害，但一般不提倡一次性加量使用。此外，还可亩用30%爱苗乳油15-20毫升，一般重病田施药2-3次，间隔期为7-10天。
