近年来，随着沙漠化、荒漠化形势的日益严峻，可耕土地越来越少。提高复种指数（重茬耕作）是解决问题的办法。然而，作物重茬易引发土传病害、土壤养分失衡土壤生态恶化等。该种现象在大棚种植中遇到较多，与其等到问题出现再解决，不如从根源入手。
1、土壤病虫危害严重
重茬田常见的病害有传染性病害、病毒；虫害主要是线虫。连续种植同一作物，使得某一种或某一类病害连年发生，病原菌聚集，破坏微生态平衡。往年残留在土壤中的病菌或虫卵，在遇到合适的条件（同一作物）后，立即爆发，严重威胁作物生长，影响产量。
2、土壤养分失衡
无论长期或者短期在同一地上种植同一作物或蔬菜，就会对某种元素吸收较多，长此以往就会导致该种元素供不应求，有些还会导致土壤酸碱度发生变化，土壤中某些元素的可利用程度也随之降低。因此，有的棉花出现缺钾症，有的包菜出现缺钙症，还有的出现缺锌、缺镁症。
3、植物自毒作用
谈到自毒作用就要谈下植物的化感作用，即植物通过对所在环境释放化学物质，从而对其它（含自身）植物或微生物产生直接或间接有害或有益感应的作用。大多化感物质为植物的次生代谢物质，这些物质通过根系分泌、残株降解以及种子萌发等方式进入土壤中，当这些物质累积至足够的浓度后，就会促进或抑制自身或其他植物的生长。
而这三种现象的出现均有着同一个原因，那就是单种作物连续种植。因此，要实现农作物持续高产优质，必须实行多样化栽培，根据自身条件确定栽培模式。
解决重茬问题首要措施就是增施有机肥，凡是土壤问题，都离不开土壤微生态平衡，增施有机肥之后，它们会修复土壤，解磷解钾，增加土壤养分的有效性。
免除和减少某些连作所特有的病虫草的危害。利用前茬作物根系分泌的素，可以抑制后茬作物上病害的发生，如甜菜、胡萝卜、洋葱、大蒜等根系分泌物可抑制马铃薯晚疫病发生，小麦根系的分泌物可以抑制茅草的生长。
合理轮作，可以使寄生性强、寄主植物种类单一及迁移能力小的病虫大量死亡。腐生性不强的病原物如马铃薯晚疫病菌等由于没有寄生植物而不能继续繁殖。
增加当季作物自身的免疫力，以上三点都是对于生长环境的优化，那么植物自身的抵抗力也是非常重要的，可以使用根法特含藻源类生物刺激素，不仅能改善土壤微生物环境，还能促生新根，养护老根，让作物吸收到充足的养分，促进植物体内的营养平衡和免疫物质的分泌。
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