红薯黑斑病又叫做黑疤病。在贮存期、育苗期、大田生长期都可能会感染此病害，是导致贮藏出现烂窖、育苗期出现烂床、栽插后死苗的主要因素之一。黑斑病能够经过病薯块、病苗、带病土壤以及肥料等多个途径进行传播。防治此病害应该采取以繁殖无病种薯为基础，培育无病健壮幼苗为中心，药剂防治为辅措施的综合防治。
一、严格实行检疫措施：
禁止调运病害薯、病害苗，发现病薯、病苗应该及时加以处理，不能进行栽植。
二、建立无病留种地：
选用有2年以上没有种植过红薯的没有病田地，自采苗圃剪取没有病害的蔓头苗栽植留种。无病留种地不可以使用带有该种病原菌的土杂肥、厩肥，如果没有净粪，可以施饼肥、化肥以及绿肥等。
三、种薯、种苗消毒处理：
种薯可以利用温汤进行浸种或是选用药剂，例如多菌灵或是甲基硫菌灵浸种进行消毒处理。种苗可以采用药剂消毒，药剂的品种与种薯相同，浓度可以比浸种的稀1倍左右。
四、避免污染肥料和薯田：
不失时机的将田间、苗床的病薯、病苗干净，避免通过各种途径污染肥料以及薯田。
