水稻稻曲病会使得水稻谷粒内形成菌丝块逐渐膨大，水稻的内外颖逐渐裂开，出现淡黄色的块状物，水稻植株渐渐呈现出黑绿色，随后破裂，会散生出墨绿色的粉末，即水稻稻曲病病菌的厚垣孢子，水稻稻曲病的病菌以落入土中菌核或附于种子上的厚垣孢子进行越冬。
在来年环境条件适宜时，菌核萌发产生厚垣孢子，由厚垣孢子再生小孢子及子囊孢子进行初侵染。水稻稻曲病的气温24-32℃病菌发育良好，在26-28℃适，低于12℃或高于36℃不能生长，水稻稻曲病随植株生长侵入水稻花器进行危害，造成谷粒发病形成稻曲病。
水稻生长过程中，施氮过量或穗肥过重加重水稻稻曲病病害的发生。
水稻稻曲病的病菌孢子借助气流传播散落，在水稻破口期侵害花器和幼器，造成谷粒发病。
为了及时的防治水稻稻曲病，应及时选用药剂进行防治。农业人员应加强水稻间的管理，应选用优质、抗病种的品种进行播种，汕优36，扬稻3号，滇粳40号均可进行播种；在水稻稻曲病经常发生期间，选用药剂开始喷洒稻瘟康按300倍液稀释，进行喷雾，重点喷药的部位是水稻植株的上部。
同时还可选用奥-力克稻瘟康50ml+大蒜油15ml，兑水30斤进行喷雾，并添加适量渗透剂如有机硅等，进行水稻全株喷雾，每隔3天用药2次，可以及时的防治水稻稻曲病；
在水稻抽穗前可选用18%多菌酮粉剂150-200g或于水稻孕穗末期每667平方米用14%络氨铜水剂250g稻丰灵200g或5%井冈霉素水剂100g，对水50L喷洒。用50%DT可湿性粉剂100-150g，对水60-75L。用40%禾枯灵可湿性粉剂，每667平方米用药60-75g，在水稻抽穗前7-10天喷用，可以及时的控制水稻稻曲病病害的扩散和蔓延。
